公园记录了鱼类3目6科14种，分别为哲罗鲑、细鳞鱼、北极茴鱼、江鳕、阿勒泰真鱥[guì]、阿尔泰杜父鱼、尖鳍鮈[jū]、北方花鳅、贝加尔雅罗鱼（小白条）、银鲫、河鲈（五道黑）、西伯利亚花鳅、湖拟鲤、白斑狗鱼，其中哲罗鲑、细鳞鱼、北极茴鱼3种属于国家二级重点保护野生鱼类。